計算機軟件著作權可以通過以下步驟進行申請：

1. 準備材料：申請表、軟件源程序、用戶手冊等相關資料。

2. 申請登記：將準備好的材料提交到國家版權局軟件登記中心，進行申請登記。

3. 審核：版權局會對申請材料進行審核，對于需要補充的材料會進行通知。

4. 登記頒發：經審核無誤后，版權局會頒發軟件著作權證書。

需要注意的是，申請軟件著作權可以通過中國版權保護中心在線免費申請，也可以找第三方代申請。